包皮與龜頭之間位置既濕且暖，容易孳生細菌，易引致包皮炎等疾病，而長期發炎會使包皮收窄，以致包莖問題。
包皮炎
包皮炎是最常見的割包皮成因。在發育期間，包皮與龜頭之間位置容易積存細菌，引致發炎及流膿。如不割除過長包皮，讓包皮退回龜頭底部，在不斷發炎的情況下，會令包皮與龜頭黏著，難以再翻開包皮清潔龜頭。
一旦出現此嚴重情況，才做割包皮手術，痊癒期要延長至六至八星期。九至十二歲的兒童較適合進行割包皮手術，因為包皮已經可完全翻開露出龜頭。
包皮過窄
不少青少年甚至四、五十歲的男性，亦因包皮過窄而要割包皮。在包皮過窄下，他們翻出包皮時會引致輕微損傷，留有疤痕，惟疤痕委縮後會令包皮出口變得更狹窄，若不斷重覆以上過程，會使包皮出口愈來愈窄，連翻開清潔也不能，故此需要進行手術。
包皮繫帶過短
患者的陰莖除了會彎曲變形，更難以翻開包皮露出龜頭清潔。
包莖
包莖患者的包皮將陰莖緊緊包裹，難以完全褪下露出龜頭部分，不少有生育需要的男性，由於恐怕精液倒流在包皮內，未能成功射精，引致不育，故此需要做割包皮手術。
衛生問題
包皮與龜頭之間位置較潮濕及溫暖，容易孳生細菌，例如念珠菌，加上若沒有徹底清潔，不但帶有異味，更會影響伴侶，令伴侶易受細菌感染。
宗教
部分家長在宗教因素下，會要求為剛出生一個月後的兒子割包皮。
